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【好书分享】生信技能学习指南

2017-05-06 沈梦圆 沈梦圆

上周我在朋友圈看到一位好友晒了一本《Bioinformatics Data Skills:Reproducible and Robust Research with Open Source Tools》。当天看见就下载了,一直到昨天才从头到尾浏览了一遍,写得相当得棒。下面我们来看看,这本书到底好在哪里~~


作者简介

写书的这位小伙以前是做生信的,现在研究进化遗传学,是戴维斯加利福尼亚大学从事进化和种群遗传学研究的@Graham_Coop的博士生。


我们来看书

如果你想学生信,上面的每一章内容都是值得去学的。现在回顾我的生信学习过程,一开始我看得是另外一本叫《Computational Biology:Unix/Linux, Data Processing and Programming》,这本书写的也是不错的,主要讲的是Linux和perl用来处理生信数据的。当时英语不好呀,所以我就去看《鸟哥的linux私房菜》和《perl语言入门》。

今天推荐的这本书涵盖了上面那本书的内容,多了生信项目管理、R语言、项目流程、数据库操作等技能实战介绍。这本书完全可以作为生信初学者的技能学习指南,5星强烈推荐。对于我来说,可以查漏补缺,例如第九章、第十二章和第十三章的技能,我都没有完全掌握,在看到这本书之前我在做生信项目的时候知道自己在这几个方面有所欠缺,现在我可以跟着这位作者好好学习这三项技能。

下面是今年我们生信技能树团队举办的生信编程实战课程,如果是生信初学者掌握上面那本书的技能后,可以做下面的题目来锻炼自己的生信编程能力。课程每道题都会用R/Shell/Python/Perl四门语言来讲,现在课程即将结束,大家可以直接购买视频合集。

课程列表:

生信编程直播第0题-生信编程很简单

生信编程直播第1题:人类基因组的外显子区域到底有多长

生信编程直播第2题:探索人类基因组序列

生信编程直播第3题:探索人类基因组注释文件

生信编程直播第4题:多个同样的行列式文件合并起来

生信编程直播第5题:根据GTF画基因的多个转录本结构

生信编程直播第6题:下载最新版的KEGG信息,并且解析好

生信编程直播第7题:写超几何分布检验

生信编程直播第8题:ID转换大全

生信编程直播第9题-根据指定染色体及坐标得到参考碱基

生信编程直播第10题:根据指定染色体及坐标得到位置信息

生信编程直播第11题:把文件内容按照染色体分开写出

生信编程直播第12题:json格式数据的格式化


写在最后

之前还写过一篇文章【生信菜鸟经】漫谈如何跨越摆在生信入门路上的三大障碍,初学者可以翻翻,另外后台回复 生信技能 就能获得上面的指导书和视频合集购买地址。

【生信技能学习指导书】

百度云链接:http://pan.baidu.com/s/1qYS8WVE 密码:vslq

【生信技能编程实战3个月合集】

微店购买链接: https://weidian.com/i/2078796268?wfr=c&ifr=itemdetail

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